登录 注册 网站导航

单分子测序系统

1/1

仪器类型: 分析仪器 仪器型号: RS II 制造厂商: Pacific Biosciences 价格: 6000元/Cell
收藏 点赞 分享到 提问题

详细信息与指标

标题 内容
功能/应用范围 1、全基因组测序 2、高GC含量区域测序 3、甲基化分析 4、稀有突变检测 5、全长cDNA测序
主要附件 系统的RS Remote远程监控软件:允许客户远程设计和监控测序过程并进行初级数据分析。系统的测序分析软件:包括SMRT Pipe、SMRT Portal和SMRT View三部分计算模块,可与用户的生物信息学平台实现无缝整合,轻松实现测序数据浏览、数据过滤和比对、诸如单核苷酸多态性(SNP)等稀有突变的可视化筛查等数据分析操作。
主要技术指标 Per Cell ≥600Mb Raw data Seq Ave Length(Polymerase):≥6Kb
技术特色 1、单分子实时检测,每条碱基链的数据都得到评估,更易发现稀有变异 2、最低DNA样品量仅500ng,无需PCR扩增,测序覆盖深度不受序列中 GC含量差异影响。可以对 100%A+T区域测序 3、除碱基序列信息外,可同时获得动力学信息,因此可对诸如 DNA甲基化之类的碱基变化情况直接进行分析 4、无与伦比的长序列读长 5、测序速度快,聚合酶反应速度(平均) 1 base/sec,从样本制备到出结果,需时 1天 6、灵活性极强,有一系列数据管理和分析软件使二代三代测序流程实现无缝整合 7、测序流程简单
服务实例 平台为上海交通大学提供青蒿(黄花蒿)基因组解析专项服务。前期运用Roche 454 GS FLX+ 长读长和Illumina Hiseq2000的Paired-End (170 bp,500bp,800 bp)和Mate-Pair end(3Kb、5Kb,10kb)不同类型的测序技术进行黄花蒿基因组序列精细图谱构建。由于青蒿基因组为野生药用二倍体基因组,重复序列高达70%,序列杂合度高达1.2%,基因组较为复杂,二代测序组装效果很不理想。后平台成功应用三代测序技术,通过三代单分子测序序列读长长的优势,有效

联系方式

联系地址 上海市浦东新区碧波路250号一号楼
联系人 金磊
联系电话 021-50801919-35
联系传真 021-51714506
电子邮箱 jinl@chgc.sh.cn
研发平台 关于数据中心 数据合作 网站导航 帮助中心 联系我们
上海科技创新资源数据中心 沪ICP备10209921号-8 沪公网安备 31010402001232号